Истории о спецагентах, павших жертвой махинаций руководства, и в результате якобы проваливших операцию, не зря так популярны. Подобные инциденты имеют место в действительности. Вот и в Alpha Protocol главного героя Майкла Тортона на очередном задании подставило начальство из ЦРУ, замешанное в правительственном заговоре. А чтобы паренёк не сболтнул лишнего, за ним устроили настоящую охоту.